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单计算节点模式部署 Cloudberry Database(引入自 v1.5.0 版本)

Cloudberry Database 与 PostgreSQL 并不完全兼容,部分功能和语法都是专有的。如果用户业务已经依赖 Cloudberry Database,想在单节点上使用 Cloudberry Database 特有的语法和功能,规避与 PostgreSQL 的兼容性问题,那么可以使用这种单计算节点的部署方式。

自 v1.5.0 起,Cloudberry Database 提供这一单计算节点的部署模式。该模式在 utility gp_role 下运行,仅有一个 coordinator (QD) 和一个 coordinator standby 节点,没有 segment 节点和数据分布。用户可以直接连接到 coordinator 并执行查询,就像连接的是一个正常的多节点集群一样。注意,由于没有数据分布,一些 SQL 语句在单计算节点部署下没有效果,还有一些 SQL 语句不受支持。具体可见最后一节用户行为变更

部署方法

第 1 步:部署前准备

使用 root 用户登录每台主机,按照以下章节的顺序,依次修改各节点主机的设置。

新增 gpadmin 管理用户

参考以下示例,创建用户组和用户名 gpadmin,将用户组和用户名的标识号设为 520,创建并指定主目录 /home/gpadmin/

groupadd -g 520 gpadmin  # _添加用户组 gpadmin_
useradd -g 520 -u 520 -m -d /home/gpadmin/ -s /bin/bash gpadmin # _添加用户名 gpadmin 并创建主目录。_
passwd gpadmin # _为 gpadmin 设置密码,执行后,按照提示输出密码。_

禁用 SELinux 和防火墙软件

执行 systemctl status firewalld 查看防火墙状态。如果防火墙处于开启状态,你需要关闭防火墙,即在 /etc/selinux/config 文件中将 SELINUX 参数设为 disabled

SELINUX=disabled

你还可以使用以下命令禁用防火墙:

systemctl stop firewalld.service
systemctl disable firewalld.service

设置系统参数

编辑 /etc/sysctl.conf 配置文件,在配置文件中添加相关系统参数,并执行 sysctl -p 命令让配置文件生效。

以下配置参数仅供参考,请按实际需要进行设置。下文介绍了其中一些配置参数的详细信息以及推荐设置。

kernel.shmall = _PHYS_PAGES / 2
kernel.shmall = 197951838
kernel.shmmax = kernel.shmall * PAGE_SIZE
kernel.shmmax = 810810728448
kernel.shmmni = 4096
vm.overcommit_memory = 2
vm.overcommit_ratio = 95
net.ipv4.ip_local_port_range = 10000 65535
kernel.sem = 250 2048000 200 8192
kernel.sysrq = 1
kernel.core_uses_pid = 1
kernel.msgmnb = 65536
kernel.msgmax = 65536
kernel.msgmni = 2048
net.ipv4.tcp_syncookies = 1
net.ipv4.conf.default.accept_source_route = 0
net.ipv4.tcp_max_syn_backlog = 4096
net.ipv4.conf.all.arp_filter = 1
net.ipv4.ipfrag_high_thresh = 41943040
net.ipv4.ipfrag_low_thresh = 31457280
net.ipv4.ipfrag_time = 60
net.core.netdev_max_backlog = 10000
net.core.rmem_max = 2097152
net.core.wmem_max = 2097152
vm.swappiness = 10
vm.zone_reclaim_mode = 0
vm.dirty_expire_centisecs = 500
vm.dirty_writeback_centisecs = 100
vm.dirty_background_ratio = 0
vm.dirty_ratio = 0
vm.dirty_background_bytes = 1610612736
vm.dirty_bytes = 4294967296
共享内存设置

/etc/sysctl.conf 配置文件中:

  • kernel.shmall 表示可用共享内存的总量,单位是页。kernel.shmmax 表示单个共享内存段的最大值,以字节为单位。

    你可以使用操作系统的 _PHYS_PAGESPAGE_SIZE 两个参数来定义这两个值:

    kernel.shmall = ( _PHYS_PAGES / 2) 
    kernel.shmmax = ( _PHYS_PAGES / 2) * PAGE_SIZE

    要获取这两个操作系统参数的值,你可以使用 getconf ,示例如下:

    $ echo $(expr $(getconf _PHYS_PAGES) / 2) 
    $ echo $(expr $(getconf _PHYS_PAGES) / 2 \$(getconf PAGE_SIZE))
  • vm.overcommit_memory 是一个 Linux 内核参数,表示系统可分配给某进程的内存大小。将 vm.overcommit_memory 设置为 2,表示当系统分配的内存超过 2 GB 时,系统会拒绝该操作。

  • vm.overcommit_ratio 是一个内核参数,是应用进程占用 RAM 的百分比。在 CentOS 上默认值为 50vm.overcommit_ratio 的计算公式如下:

    vm.overcommit_ratio = (RAM - 0.026 * gp_vmem) / RAM

其中 gp_vmem 的计算方法如下:

# 如果系统内存低于 256 GB, 使用如下公式计算:
gp_vmem = ((SWAP + RAM) – (7.5GB + 0.05 * RAM)) / 1.7

# 如果系统内存大于等于 256 GB, 使用如下公式计算:
gp_vmem = ((SWAP + RAM) – (7.5GB + 0.05 * RAM)) / 1.17

# 以上公式中,SWAP 是主机上的交换空间,以 GB 为单位。
# RAM 是主机上安装的内存大小,以 GB 为单位。
IP 分段设置

当 Cloudberry Database 内部连接使用 UDP 协议,网卡会控制 IP 数据包的分段和重组。如果 UDP 消息的大小大于网络最大传输单元 (MTU) 的大小,IP 层会对消息进行分段。

  • net.ipv4.ipfrag_high_thresh:当 IP 分片的总大小超过该阈值时,内核将尝试对 IP 分片进行重组。如果分片超过了这个阈值,但全部片段在规定的时间内仍未到达,内核则不会重组这些分片。该阈值通常用于控制是否对较大的分片进行重组。默认值为 4194304 字节(即 4 MB)。
  • net.ipv4.ipfrag_low_thresh:表示当 IP 分片的总大小低于该阈值时,内核将尽可能地等待更多分片到达,以便进行更大的重组。这个阈值的目的是尽量减少未完成的重组操作,以提高系统性能。默认值为 3145728 字节(3 MB)。
  • net.ipv4.ipfrag_time 是一个控制 IP 分片重组超时时间的内核参数,默认值是 30

推荐将以上参数设为如下值:

net.ipv4.ipfrag_high_thresh = 41943040 
net.ipv4.ipfrag_low_thresh = 31457280
net.ipv4.ipfrag_time = 60
系统内存
  • 如果服务器内存超过 64 GB,建议在 /etc/sysctl.conf 配置文件中进行如下参数设置:

    vm.dirty_background_ratio = 0
    vm.dirty_ratio = 0
    vm.dirty_background_bytes = 1610612736 # 1.5GB
    vm.dirty_bytes = 4294967296 # 4GB
  • 如果服务器内存低于 64 GB,则不需要设置 vm.dirty_background_bytesvm.dirty_bytes,建议在 /etc/sysctl.conf 配置文件中进行如下参数设置:

    vm.dirty_background_ratio = 3 
    vm.dirty_ratio = 10
  • 为了应对系统出现内存压力时的紧急情况,建议在 /etc/sysctl.conf 配置文件中新增 vm.min_free_kbytes 参数,用于控制系统保留的可用内存量。建议将 vm.min_free_kbytes 设置为系统物理内存的 3%,命令如下:

    awk 'BEGIN {OFMT = "%.0f";} /MemTotal/ {print "vm.min_free_kbytes =", $2 * .03;}' /proc/meminfo  /etc/sysctl.conf
  • vm.min_free_kbytes 的设置不建议超过系统物理内存的 5%。

资源限制设置

编辑 /etc/security/limits.conf 文件并添加如下内容,这将对软硬件资源用量进行限制。

*soft nofile 524288
*hard nofile 524288
*soft nproc 131072
*hard nproc 131072
核心转储(CORE DUMP)设置
  1. 添加以下参数至 /etc/sysctl.conf 配置文件:

    kernel.core_pattern=/var/core/core.%h.%t
  2. 执行以下命令使配置生效:

    sysctl -p
  3. 添加以下参数至 /etc/security/limits.conf

    soft core unlimited
为 XFS 文件系统设置挂载选项

XFS 是 Cloudberry Database 数据目录的文件系统,XFS 使用以下选项进行挂载:

rw,nodev,noatime,inode64

你可以在 /etc/fstab 文件中设置 XFS 文件挂载,参考如下命令。你需要根据实际情况选择文件路径:

mkdir -p /data0/
mkfs.xfs -f /dev/vdc
echo "/dev/vdc /data0 xfs rw,nodev,noatime,nobarrier,inode64 0 0" /etc/fstab
mount /data0
chown -R gpadmin:gpadmin /data0/

执行以下命令查看挂载是否成功:

df -h
预读值设置

每个磁盘设备文件的预读 (blockdev) 值应该是 16384。要验证磁盘设备的预读取值,你可以使用以下命令:

sudo /sbin/blockdev --getra <devname>

例如,验证本文示例服务器硬盘的文件预读值:

sudo /sbin/blockdev --getra /dev/vdc

要修改设备文件的预读值,你可以使用以下命令:

sudo /sbin/blockdev --setra <bytes> <devname>

例如,修改本文档服务器硬盘的文件预读值:

sudo /sbin/blockdev --setra 16384 /dev/vdc
磁盘的 I/O 调度策略设置

Cloudberry Database 的磁盘类型、操作系统以及调度策略如下:

存储设备类型OS推荐的调度策略
NVMeRHEL 7none
RHEL 8none
Ubuntunone
SSDRHEL 7noop
RHEL 8none
Ubuntunone
其他RHEL 7deadline
RHEL 8mq-deadline
Ubuntumq-deadline

参考以下命令修改调度策略。注意,该命令仅为临时修改,服务器重启后,修改将失效。

echo schedulername  /sys/block/<devname/queue/scheduler

例如,临时修改本文档服务器磁盘 I/O 调度策略:

echo deadline  /sys/block/vdc/queue/scheduler

若要永久修改调度策略,你可以使用系统实用程序 grubby。通过 grubby 修改后,重启服务器后立即生效,示例命令如下所示:

grubby --update-kernel=ALL --args="elevator=deadline"

可以通过如下命令查看内核参数设置:

grubby --info=ALL
禁用透明大页面 (THP)

你需要禁用透明大页面 (THP),因为它会降低 Cloudberry Database 的性能。禁用的命令如下所示:

grubby --update-kernel=ALL --args="transparent_hugepage=never"

通过如下命令查看 THP 的状态:

cat /sys/kernel/mm/*transparent_hugepage/enabled
禁用 IPC 对象删除

禁用 IPC 对象删除,即把 RemoveIPC 的值设为 no。你可以在 Cloudberry Database 的 /etc/systemd/logind.conf 文件中设置该参数。

RemoveIPC=no

禁用后,执行如下命令重启服务器使得禁用设置生效:

service systemd-logind restart
SSH 连接数阈值设置

要设置 SSH 连接数阈值,你需要修改 /etc/ssh/sshd_config 配置文件中的 MaxStartups 以及 MaxSessions 参数。以下两种写法均可。

MaxStartups 200
MaxSessions 200
MaxStartups 10:30:200
MaxSessions 200

执行如下命令重启服务器使得设置生效:

service sshd restart
时钟同步设置

Cloudberry Database 要求为所有主机配置时钟需要同步,时钟同步服务应当随主机启动而启动。有两种同步方式:

  • 使用 Coordinator 节点的时间作为来源,其他主机同步 Coordinator 节点主机的时钟。
  • 使用外部时钟来源同步。

本文档示例使用外部时钟来源同步,即在 /etc/chrony.conf 配置文件中添加如下配置:

# 使用 pool.ntp.org 项目的公共服务器
# 可考虑加入 pool (http://www.pool.ntp.org/join.html)
server 0.centos.pool.ntp.org iburst

设置后,可执行如下命令查看时钟同步状态:

systemctl status chronyd

第 2 步:通过 RPM 包安装 Cloudberry Database

  1. 下载 Cloudberry Database 的 RPM 安装包至 gpadmin 主目录 /home/gpadmin/

    wget -P /home/gpadmin <下载地址>
  2. /home/gpadmin 目录下安装 RPM 包。

    执行以下命令时,你需要将 <RPM 安装包路径> 替换为实际的安装包路径,并使用 root 用户执行。安装时,会自动创建默认安装目录 /usr/local/cloudberry-db/

    cd /home/gpadmin
    yum install <RPM 安装包路径>
  3. gpadmin 用户授予安装目录的权限:

    chown -R gpadmin:gpadmin /usr/local
    chown -R gpadmin:gpadmin /usr/local/cloudberry*
  4. 配置节点的本地 SSH 登录。在 gpadmin 用户下:

    ssh-keygen
    ssh-copy-id localhost
    ssh `hostname` # 确认本地 SSH 登录能正常工作

第 3 步:部署单计算节点的 Cloudberry Database

使用脚本工具 gpdemo 快速部署 Cloudberry Database。gpdemo 包含在 RPM 包中,将随配置脚本(gpinitsystem、gpstart、gpstop 等)一并安装到 GPHOME/bin 目录下,支持快捷部署无 Segment 节点的 Cloudberry Database。

在上面为 XFS 文件系统设置挂载选项中,XFS 文件系统的数据目录挂载在了 /data0 上。以下指令在该数据目录下部署一个单计算节点集群:

cd /data0
NUM_PRIMARY_MIRROR_PAIRS=0 gpdemo # 使用 gpdemo 工具

gpdemo 的执行过程中,会输出一条新的警告 [WARNING]:-SinglenodeMode has been enabled, no segment will be created.,这表示当前正以单计算节点模式部署 Cloudberry Database。

常见问题

如何确认集群的部署模式

执行以下步骤确认当前 Cloudberry Database 的部署模式:

  1. 连接到 Coordinator 节点。

  2. 执行 SHOW ``gp_role``; 查看当前集群的运行模式。

    • 如果结果返回 utility,表示集群处于 Utility 运行模式,即维护模式,该模式下只有 Coordinator 节点可用。

      此时继续执行 SHOW ``gp_internal_is_singlenode``; 查看集群是否是单计算节点模式。

      • 如果结果返回 on,表示当前集群是单计算节点模式。
      • 如果结果返回 off,表示当前集群是普通维护模式 (utility maintenance mode)。
    • 如果结果返回 dispatch,表示当前集群是包含 Segment 节点的普通集群。你可以通过 SELECT * FROM gp_segment_configuration; 进一步确认集群的 Segment 数量、状态、端口、数据目录等信息。

数据目录位置在哪里

gpdemo 会自动在当前路径 ($PWD) 下创建数据目录。对于单计算节点部署:

  • Coordinator 默认目录为:./datadirs/singlenodedir
  • Coordinator Standby 默认目录为:./datadirs/standby

实现原理

启用单计算节点部署时,部署脚本将向配置文件 postgresql.conf 中写入 gp_internal_is_singlenode = true,并以 gp_role = utility 参数启动一个 Coordinator 和一个 Coordinator standby 节点。所有数据均写入本地,没有 Segment 和数据分布。

用户行为变更

在单计算节点模式下, Cloudberry Database 的产品行为有如下变更,用户在执行相关操作前需注意:

  • 在使用 CREATE TABLE 语句建表时,DISTRIBUTED BY 子句不再生效。执行此类语句时,该子句的效果将被忽略,并输出一条新的警告 WARNING: DISTRIBUTED BY clause has no effect in singlenode mode
  • SELECT 语句的 SCATTER BY 子句不再有效。执行此类语句时,该子句的效果将被忽略,并输出一条新的警告 WARNING: SCATTER BY clause has no effect in singlenode mode
  • 其他不再支持的语句(例如 ALTER TABLE SET DISTRIBUTED BY)将以**错误(ERROR)**指出并拒绝执行。
  • 由于没有 Segment 而不存在全局事务和全局死锁,UPDATEDELETE 语句的锁级别将从 ExclusiveLock 独占锁降低至 RowExclusiveLock 行意向锁以提供更好的并发性能。该行为和 PostgreSQL 是一致的。